DNA測序的操作步驟
DNA(為英文Deoxyribonucleic acid的縮寫(xiě)),又稱(chēng)脫氧核糖核酸,是染色體的主要化學(xué)成分,同時(shí)也是基因組成的,有時(shí)被稱(chēng)為“遺傳微!。DNA是一種分子,可組成遺傳指令,以引導生物發(fā)育與生命機能運作。主要功能是長(cháng)期性的資訊儲存,可比喻為“藍圖”或“食譜”。其中包含的指令,是建構細胞內其他的化合物,如蛋白質(zhì)與RNA所需。帶有遺傳訊息的DNA片段稱(chēng)為基因,其他的DNA序列,有些直接以自身構造發(fā)揮作用,有些則參與調控遺傳訊息的表現。
DNA測序
1.PCR測序反應
(1) 取0.2ml的PCR管,用記號筆編號,將管插在顆粒冰中,總反應體積5μl,不加輕礦物油或石蠟油,蓋緊PCR管,用手指彈管混勻,稍離心。
(2) 將PCR管置于9600或2400型PCR儀上進(jìn)行擴增。98℃變性2min后進(jìn)行PCR循環(huán),PCR循環(huán)參數為96℃ 10s,50℃ 5s,60℃4min,25個(gè)循環(huán),擴增結束后設置4℃保溫。
2.醋酸鈉/乙醇法純化PCR產(chǎn)物
(1) 將混合物離心,將擴增產(chǎn)物轉移到1.5ml EP管中。
(2) 加入25μl醋酸鈉/乙醇混合液,充分振蕩,置冰上10min以沉淀DNA。12000r/min于4℃離心30 min,小心棄上清。
(3) 加70%(V/V)的乙醇50μl洗滌沉淀2次。12000r/min于4℃離心5min,小心棄上清和管壁的液珠,真空干燥沉淀10~15min。
3.電泳前測序PCR產(chǎn)物的處理。
(1) 加入12μl的TSR于離心管中,劇烈振蕩,讓其充分溶解DNA沉淀,稍離心。
(2) 將溶液轉移至蓋體分離的0.2ml PCR管中,稍離心。
(3) 在PCR儀上進(jìn)行熱變性(95℃ 2min),冰中驟冷,待上機。
4.上機操作按儀器操作說(shuō)明書(shū)安裝毛細管,進(jìn)行毛細管位置的校正,人工手動(dòng)灌膠和建立運行的測序順序文件。儀器將自動(dòng)灌膠至毛細管,1.2kV預電泳5min,按編程次序自動(dòng)進(jìn)樣,再預電泳(1.2kV,20min),在7.5kV下電泳2h。電泳結束后儀器會(huì )自動(dòng)清洗,灌膠,進(jìn)下一樣品,預電泳和電泳。每一個(gè)樣品電泳總時(shí)間為2.5h。電泳結束后儀器會(huì )自動(dòng)分析或打印出彩色測序圖譜。
5.儀器將自動(dòng)進(jìn)行序列分析,并可根據用戶(hù)要求進(jìn)行序列比較。如測序序列已知,可通過(guò)序列比較以星號標出差異堿基處,提高工作效率。
6.測序完畢按儀器操作規程進(jìn)行儀器清洗與保養。